NCM 大会技术升级发布——准确率

2021-12-13 09:19 · 生物探索

12月14日，术升邀请到四位科学家分享关于他们使用纳米孔测序进行研究的布准成果，演讲主题涵盖利用纳米孔测序研究基因组结构、确率全长转录组等等方面。术升

12月14日，布准我们邀请到四位具有丰富纳米孔测序经验的确率科学家分享关于他们使用纳米孔测序进行研究的成果，演讲主题涵盖利用纳米孔测序研究基因组结构、术升全长转录组、布准简化携带者筛选工作流程、确率使用纳米孔测序Q20+试剂盒和R10.4测序芯片的术升结果展示，以及来自Oxford Nanopore的布准最新技术进展。报名方式和更多详情请查看：【免费注册】12月14日：纳米孔科研团队大会 NCM 2021 Collection。确率

Oxford Nanopore开发的术升是新一代的测序传感技术，结合了便携式到超高通量格式的布准可扩展性与实时数据传输，通过分析天然 DNA / RNA 序列片段来阐明准确、确率丰富的生物数据，包括甲基化修饰检测。

Oxford Nanopore的纳米孔测序平台具有高准确度、高通量、信息丰富、多样化平台设备的特点。纳米孔测序无读长限制，能够对包括短读长在内的任何DNA序列长度片段进行测序：读长长度=DNA片段长度；读长数量=产出/读长长度

纳米孔测序的准确度一直是大家所关注的话题。在Oxford Nanopore, 我们一直致力于通过多种以下方式提高准确度，这包括精确的纳米孔设计和改造马达蛋白酶；改进算法来推动更好的碱基识别，并通过还控制设备和耗材的运行条件来进行更好的信号分析。

在讨论准确度之前，定义我们所谈论的准确度类型十分重要。这包括原始读长单链（simplex）准确度、双链（duplex）准确度、共有序列（consensus）或检测准确度。

原始读长（或单链）准确度

纳米孔测序提供对目标分子的直接电子分析，碱基识别算法被随后用来解读生产的测序读长序列。纳米孔碱基识别算法随时间不断提升以增强准确率，同时新的方法也可以被应用于既往已测序过的原始数据进行重新碱基识别。

我们将原始读长准确度定义为一次读取单个 DNA 或 RNA 片段/分子所达到的准确度。使用最新的R10.4版纳米孔测序芯片，搭配新版试剂盒12系列（SQK-LSK112）试剂盒可达99%。

双链准确度（Duplex）

可对单个分子的双链进行测序，并能够达到约 Q30 (99.9%)的准确度。使用纳米孔测序。还可以在测序过程中额外免费获取甲基化修饰信息。

共有序列（Consensus）准确率

将一个特定DNA/RNA区域的多个拷贝堆叠，意味着随机错误被平均“抵消”，产生一个更准确的一致性“共有”序列。

当使用最新的纳米孔特定分析工具时，即使是在 20X 覆盖度也可以获达 Q50 (99.999%) 以上的细菌基因组。

提高准确率的多种方式

多年来，Oxford Nanopore 不断通过技术迭代来提高性能。仅通过算法和化学试剂的改进，使用R9 版纳米孔和 Kit 10试剂盒，我们在约 2 年时间内便从约 92% 的原始读长准确度迭代到了 >98%。现在我们还推出了R10.4 纳米孔和 Kit 12试剂盒，可达原始读长准确度超过 99%。

用户现在还可以根据不同程度的需求选择碱基识别方式。快速识别模式（Fast）可用于我们所有的设备，用户还可以选择“高精度碱基识别模式”（Hac）或“超高准确度”（Sup）来获得最高准确度。

在甲基化修饰检测方面，Oxford Nanopore 推出了一种用于甲基化分析的新工具Remora。该工具可与碱基识别并行，在同一实验中进行甲基化分析的同时无需牺牲准确性及时效性。以仅20 倍的覆盖度，Remora 可提供行业领先的性能。目前可以在研究版的Bonito软件中用于 5mC 和 5hmC检测识别，并预计于 2022 年初整合到 Guppy碱基识别软件中。

* Oxford Nanopore Technologies 产品并非旨在用于健康评估或诊断、治疗、缓解、治愈或预防任何疾病或状况